PESQUISA VETERINÁRIA BRASILEIRA

Abstract in English:

This study performed a molecular detection and characterization of Giardia duodenalis infecting pigs, goats and sheep in rural and peri-urban communities in the state of Piauí, northeastern Brazil, and proposed phylogenetic relationships among the characterized parasites. We assessed 52 fecal samples from pigs, 13 from goats, and 10 from sheep. A fragment of the β-giardin locus was PCR-amplified and sequenced. Overall, PCR-based G. duodenalis positivity was 11/52 (21.2%) in pigs, 2/13 (15.4%) in goats, and 2/10 (20%) in sheep. Seven out of 15 successfully amplified samples could be sequenced: three from pigs, two from goats, and two from sheep. Parasites from different hosts were found to belong to sub-assemblage AII. The phylogenetic analyses of the original G. duodenalis AII β-giardin sequences obtained from distinct host species and sequences of G. duodenalis recovered from humans available in GenBank suggest that the parasites are genetically related, supporting a local scenario of cross-host transmission.

• Giardia duodenalis pigs goat sheep β-giardin DNA sequencing Brazil

Abstract in Portuguese:

Este estudo teve como objetivo detectar e caracterizar geneticamente amostras de Giardia duodenalis recuperadas de suínos, caprinos e ovinos em comunidades rurais do estado do Piauí, no nordeste do Brasil, propondo relações filogenéticas entre os parasitas caracterizados. Foram estudadas 52 amostras fecais de suínos, 13 de caprinos e 10 de ovinos. Uma região (560 pb) do lócus codificante da β-giardina foi amplificada por PCR e submetida a sequenciamento nucleotídico. A positividade para G. duodenalis pela PCR foi 11/52 (21,2%) em suínos, 2/13 (15,4%) em caprinos e 2/10 (20%) em ovinos. De 15 amostras amplificadas, sete puderam ser sequenciadas: três obtidas de suínos, dois de caprinos e dois de ovinos. Todas foram caracterizadas como pertencentes à subassemblage AII. Análises filogenéticas de amostras de G. duodenalis AII identificadas em diferentes hospedeiros, incluindo sequências de parasitas recuperadas de humanos e obtidas no GenBank, sugerem que os isolados têm alto grau de homologia. Os resultados apontam para um cenário de transmissão cruzada entre diferentes espécies de hospedeiros.

• Giardia duodenalis suínos caprinos ovinos β-giardina sequenciamento de DNA Brasil

Abstract in English:

ABSTRACT.- Lange C.C., Brito M.AV.P., Brito J.R.F., Arcuri E.F., Souza G.N., Machado M.A., Domingues R. & Salimena A.P.S. 2011. [Identification of Staphylococcus strains isolated from bovine mastitis by PCR and 16S rDNA sequencing.] Uso de PCR e sequenciamento do rDNA 16S para identificação de bactérias do gênero Staphylococcus isoladas de mastite bovina. Pesquisa Veterinária Brasileira 31(1):36-40. Embrapa Gado de Leite, Rua Eugênio do Nascimento 610, Juiz de Fora, MG 36030-330, Brazil. E-mail: clange@cnpgl.embrapa.br The objective of this study was to identify the species of 100 isolates of Staphylococcus from mastitis in dairy cows from herds located in the state of Minas Gerais, Brazil. PCR reactions were carried out using specific primers described previously for S. aureus (femA gene), S. intermedius (16S rDNA) and S. hyicus (16S-23S rDNA spacer region). In addition, products of amplification of variable regions of the 16S rDNA gene of the strains were sequenced. According to the results of the PCR, 83 strains were identified as S. aureus, 13 as S. intermedius, two as S. hyicus and two isolates were not identified. The sequencing of 16S rDNA was applied to 23 strains identified by PCR amplifications: six S. aureus and the strains identified as S. intermedius (n=13), S. hyicus (n=2) or not identified (n=2). The sequencing of 16S rDNA confirmed the six strains as S. aureus. The others 17 strains were identified as S. chromogenes (13 isolates) and S. hyicus (four isolates). Each sample was related to a specie according to the smallest E-value and highest similarity (³ 99%). The identification of S. hyicus and S. chromogenes was accomplished only by 16S rDNA sequencing.

• Staphylococcus aureus S. chromogenes S. hyicus

Abstract in Portuguese:

RESUMO.- Lange C.C., Brito M.AV.P., Brito J.R.F., Arcuri E.F., Souza G.N., Machado M.A., Domingues R. & Salimena A.P.S. 2011. [Identification of Staphylococcus strains isolated from bovine mastitis by PCR and 16S rDNA sequencing.] Uso de PCR e sequenciamento do rDNA 16S para identificação de bactérias do gênero Staphylococcus isoladas de mastite bovina. Pesquisa Veterinária Brasileira 31(1):36-40. Embrapa Gado de Leite, Rua Eugênio do Nascimento 610, Juiz de Fora, MG 36030-330, Brazil. E-mail: clange@cnpgl.embrapa.br O objetivo deste trabalho foi identificar espécies de Staphylococcus (n=100) isoladas de mastite em rebanhos bovinos do Estado de Minas Gerais. Para esta finalidade foram utilizadas reações de PCR empregando oligonucleotídeos iniciadores descritos anteriormente para amplificar genes específicos de S. aureus (femA), S. intermedius (rDNA 16S) e S. hyicus (rDNA 16S-23S) e o sequenciamento do rDNA 16S. De acordo com as reações de PCR, 83 isolados foram identificados como S. aureus, 13 isolados como S. intermedius, dois como S. hyicus e dois isolados não foram identificados. Foram submetidos ao sequenciamento do rDNA 16S seis isolados identificados como S. aureus e os 17 restantes. Os seis isolados identificados como S. aureus confirmaram essa identificação. Dos outros 17 isolados, 13 foram identificados como S. chromogenes e quatro como S. hyicus, com similaridade igual ou superior a 99%. Baseando-se nos resultados da reação de PCR do gene femA e do sequenciamento do rDNA 16S, foram identificados 83 S. aureus, 13 S. chromogenes e quatro S. hyicus. Neste estudo os oligonucleotídeos iniciadores empregados na reação de PCR para S. intermedius não foram específicos, pois amplificaram também S. chromogenes; e os empregados na reação de PCR para S. hyicus não foram sensíveis, pois falharam na identificação de dois isolados de S. hyicus. A identificação definitiva das duas últimas espécies somente foi possível pelo sequenciamento do rDNA 16S.